东京的爱丽丝学园（全称：国立爱丽丝研究机关学园本部）是一所特别的学校，只招收具有特殊能力「爱丽丝」的人，一旦入学就要等到毕业才可以离开学校。青梅竹马、犹如姐妹般的搭档今井萤在走之前才告诉蜜柑从乡间小学转入城里的学校的消息…

玲子的孙子夏目贵志从外婆的遗物中得到了那些契约书所做成的“友人帐”，同样他也能看到不会显现在人前的物体。而且也和玲子一样成为了被周围人疏远的一员，被同龄人叫成“骗子”。 可是，作为唯一继承了玲子血统的他却做出了一个重要的…