福建沿海的一个美丽城市，一家小客栈借着政府鼓励的小三通的东风，生意办得红红火火。小客栈在为两岸的人们提供着便利的同时，也发生了很多感人的故事。客栈的主人蔡金龙是当年金门战役的老兵，努力经营着一家客栈，并有意让自己的儿子蔡…

《船来船往》是一部以金厦等地的小三通为时代背景，以直航码头边的私家旅馆老榕树客栈为主题情景空间，以客栈主人和形形色色不同身份的房客为主要人物关系，讲述了两岸人民同根同源，血肉相亲的动人故事。