故事延续第一季，原石反应堆计划在上京市遭到王一飞等人的破坏后，王一飞被神秘的黑甲武士掠走，去向不明。与此同时，来自南海边陲的除魔少女唐寻嫣带着她的守护者燕青，踏上了这片是非之地。盘古少爷丁思聪渔翁得利成功接管盘古集团后，…

少年王一飞自幼丧父，在一次意外事件中发现自己身上的家传玉石似乎与科技巨头盘古集团的能源项目相关，并在启蒙者唐小盼的帮助下掌握了天选者的超能力，但同时也卷入了一场神秘的案件当中，开始了一段不为人知的英雄故事。