2027年6月6日的一天，隶属陆军机密部队501机关的真室中佐在闹市街头被人杀害，此前他曾陷入军火买卖的贿赂丑闻不得脱身，他对死亡背后自然隐藏着无数谜团。阴雨之夜，试图取回真室电子脑的公安9课课长荒卷大辅与生化人草薙素子在真室中佐…

大元帅系真言密教宗派之一光言宗有一种神秘的法术，令那些对人世间仍有眷恋的女性死尸变成有思想有感情能走动的尸姬。尸姬的能力比常人强数倍，更有不死之身，她们必须与光言宗的和尚订下契约，把其他为祸人间的僵尸杀死。只要杀满一百零…

本作的主人公是一位名叫津崎青叶的女孩，她明亮开朗，富有朝气。某天，津崎青叶突然被神秘人士绑架，并被带到南美洲委内瑞拉一个叫做“天使”的组织里。在那里在，津崎青叶被迫成为了叫做“人机”的巨型机器人兵器的驾驶员。而青叶的好朋…