距离暗杀杀老师（二宫和也配音）的最后期限越来越近，一直潜伏在三年E班的秘密武器也终于出动。背负莫大仇恨的茅野枫（山本舞香饰）露出了隐藏已久的触角，向杀老师展开绝命袭击。恰恰借助这一事件，杀老师讲述了自己和E班曾经的代课老师…

故事叙述在遥远的时空，太空船“威卡诺伊号”在航行途中遭遇变故而坠毁在“艾斯多利亚双子星”上，威卡诺伊号太空船的电脑中枢与艾斯多利亚星的神秘能量结合，成为全新生命体“AXIS”并进一步使整个艾斯多利亚星产生异变，让该星球的植物…